Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRB3Q04118 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRB3Q04118 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms