Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ERCC6Q03468 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms