Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms