Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms