Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDKL1Q00532 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms