Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK3Q00526 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms