Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRB1P82279 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CRB1P82279 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRB1P82279 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRB1P82279 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRB1P82279 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRB1P82279 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRB1P82279 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRB1P82279 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRB1P82279 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRB1P82279 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRB1P82279 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRB1P82279 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CRB1P82279 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CRB1P82279 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRB1P82279 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRB1P82279 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRB1P82279 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRB1P82279 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRB1P82279 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRB1P82279 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB1P82279 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB1P82279 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB1P82279 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB1P82279 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB1P82279 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB1P82279 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB1P82279 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB1P82279 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB1P82279 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB1P82279 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB1P82279 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB1P82279 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB1P82279 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB1P82279 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB1P82279 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB1P82279 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB1P82279 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB1P82279 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB1P82279 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB1P82279 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB1P82279 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB1P82279 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB1P82279 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB1P82279 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB1P82279 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB1P82279 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB1P82279 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB1P82279 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB1P82279 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB1P82279 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB1P82279 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB1P82279 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB1P82279 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms