Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP6P59044 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP6P59044 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms