Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLDN15P56746 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms