Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSWP56202 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSWP56202 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSWP56202 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSWP56202 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSWP56202 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSWP56202 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms