Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BGRP55822 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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