Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD23AP54725 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms