Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP2S1P53680 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms