Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPAP53621 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPAP53621 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPAP53621 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms