Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP98P52948 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP98P52948 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP98P52948 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP98P52948 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP98P52948 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP98P52948 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP98P52948 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP98P52948 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP98P52948 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP98P52948 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP98P52948 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP98P52948 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP98P52948 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP98P52948 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP98P52948 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP98P52948 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP98P52948 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP98P52948 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP98P52948 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP98P52948 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP98P52948 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP98P52948 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP98P52948 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP98P52948 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP98P52948 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP98P52948 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP98P52948 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP98P52948 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP98P52948 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP98P52948 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP98P52948 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP98P52948 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP98P52948 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP98P52948 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP98P52948 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP98P52948 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP98P52948 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP98P52948 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP98P52948 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP98P52948 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP98P52948 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP98P52948 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP98P52948 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP98P52948 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP98P52948 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP98P52948 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms