Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms