Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1A1P48729 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSNK1A1P48729 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms