Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD52P43351 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD52P43351 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms