Protein–RNA interactions for Protein: P42771

CDKN2A, Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AP42771 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2AP42771 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms