Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIK3CBP42338 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms