Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACVR1BP36896 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACVR1BP36896 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms