Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP214P35658 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP214P35658 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP214P35658 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP214P35658 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP214P35658 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP214P35658 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP214P35658 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms