Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DDIT3P35638 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DDIT3P35638 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDIT3P35638 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDIT3P35638 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDIT3P35638 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DDIT3P35638 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DDIT3P35638 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDIT3P35638 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDIT3P35638 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDIT3P35638 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms