Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms