Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC4P35249 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC4P35249 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC4P35249 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC4P35249 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC4P35249 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC4P35249 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC4P35249 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC4P35249 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC4P35249 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC4P35249 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC4P35249 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC4P35249 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC4P35249 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC4P35249 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC4P35249 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC4P35249 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC4P35249 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC4P35249 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC4P35249 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC4P35249 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC4P35249 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC4P35249 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC4P35249 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC4P35249 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC4P35249 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC4P35249 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RFC4P35249 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RFC4P35249 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC4P35249 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFC4P35249 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC4P35249 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC4P35249 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC4P35249 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC4P35249 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC4P35249 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC4P35249 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC4P35249 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFC4P35249 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms