Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP6P35125 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP6P35125 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP6P35125 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP6P35125 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
USP6P35125 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP6P35125 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP6P35125 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP6P35125 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP6P35125 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP6P35125 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP6P35125 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP6P35125 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP6P35125 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP6P35125 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP6P35125 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP6P35125 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP6P35125 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP6P35125 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP6P35125 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP6P35125 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP6P35125 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP6P35125 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP6P35125 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP6P35125 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP6P35125 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP6P35125 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP6P35125 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms