Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCC1P33527 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms