Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTX2P32243 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTX2P32243 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTX2P32243 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
OTX2P32243 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
OTX2P32243 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
OTX2P32243 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms