Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC12P31275 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms