Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ALDH4A1P30038 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms