Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB2P29033 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB2P29033 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GJB2P29033 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms