Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB4P28070 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms