Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMLP26374 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMLP26374 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMLP26374 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMLP26374 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMLP26374 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMLP26374 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMLP26374 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMLP26374 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMLP26374 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMLP26374 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMLP26374 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMLP26374 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMLP26374 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMLP26374 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMLP26374 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMLP26374 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMLP26374 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMLP26374 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMLP26374 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms