Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMA3P25788 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms