Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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PTPRBP23467 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTPRBP23467 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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