Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCSHP23434 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCSHP23434 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCSHP23434 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GCSHP23434 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCSHP23434 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSHP23434 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSHP23434 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSHP23434 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSHP23434 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSHP23434 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSHP23434 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCSHP23434 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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