Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms