Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS1P17812 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms