Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB3P16520 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNB3P16520 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNB3P16520 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNB3P16520 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNB3P16520 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB3P16520 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB3P16520 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB3P16520 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms