Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA1P14867 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms