Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB1P14653 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms