Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR2C1P13056 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NR2C1P13056 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms