Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms