Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODC1P11926 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODC1P11926 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODC1P11926 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODC1P11926 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODC1P11926 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODC1P11926 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODC1P11926 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODC1P11926 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODC1P11926 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODC1P11926 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODC1P11926 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODC1P11926 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODC1P11926 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODC1P11926 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms