Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GZMBP10144 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GZMBP10144 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GZMBP10144 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GZMBP10144 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GZMBP10144 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GZMBP10144 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GZMBP10144 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GZMBP10144 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GZMBP10144 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GZMBP10144 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GZMBP10144 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GZMBP10144 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GZMBP10144 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GZMBP10144 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GZMBP10144 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GZMBP10144 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GZMBP10144 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GZMBP10144 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GZMBP10144 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GZMBP10144 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GZMBP10144 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GZMBP10144 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms