Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBSLP0DN79 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CBSLP0DN79 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms