Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms