Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CT47B1P0C2W7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms