Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms