Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms